冲绳国际大学将建设服务于地区的大学作为一个目标。因此，冲绳国际大学综合研究机构的4个研究所对在“冲绳”这一地理和社会空间呈现的各种现象进行研究，并将其研究成果还原给地区。除此以外，还在校内外举办面向普通县民的市民讲座，从而打造出一所真正扎根于地区的大学。

南岛文化研究所

　　南岛文化研究所作为从事跨学科联合研究的场所，成立于1978年4月。本所旨在为以琉球弧群岛为对象的学术研究的发展做出贡献，每年从奄美群岛、冲绳群岛、宫古群岛、八重山群岛中锁定地区开展综合调查。同时赴中国福建省、台湾地区及韩国，尝试将琉球文化与这些地区的文化分别做比较研究，保持研究人员之间的交流。另外还致力于收集珍贵的文献资料并整理保存，以供学生及普通市民使用。
　　本研究所汇总期刊《南岛文化》及上述综合调查的成果，每年发行报告书。另外，与当地报社合作，在那霸市、宜野湾市、石垣市、冲绳市、西原町等地举办南岛文化市民讲座。带领学生走访县内各地，学习历史、文化、自然、地理等。除此以外，本所还持续开展岛屿研究会、南岛研研讨会、调查报告演讲会等研究和报告活动。

产业综合研究所

　　产业综合研究所成立于1991年4月，旨在从国际性、综合性的视角出发从事产业相关的理论和实证研究，从而为学术振兴和产业社会的发展做出贡献。除本所研究人员（本校教师）外，还委托产业经济界、行政机关以及国内外的大学、研究所等的众多专家担任特别研究员，在展望具有地理、历史及文化特征的冲绳县的产业经济独立发展的同时，跨地区广泛地建立产业、政府及学术界的多种研究人才和信息网络，为在国际范围内推进学术联合研究而努力。本研究所是冲绳地区唯一一家从事综合产业研究的机构，在为肩负着独特的目的和重任而自豪的同时，今后将继续鼓励多种研究人才自由参加，通过跨学科联合研究，力求成为能够为地区产业社会振兴做出贡献的研究所。

冲绳法政研究所

　　冲绳法政研究所作为研究法律和政治领域中各类问题的场所而成立。虽说自从回归“本土”以来已经过了40年，但冲绳在各个方面存在大量“本土”各县所没有的可称为“战争后遗症”的遗留问题有待解决。例如，血缘社会所特有的门中制度、起因于战后美国统治的国籍问题、围绕国际养子结亲及尖阁诸岛归属的问题等，冲绳相对于日本“本土”具有历史、地理及文化上的特殊性，由此而引发了各种问题。本所的目的在于将学术研究聚焦于由这些外因和内因而产生的法律和政治上的各类问题，并提出一定的建议。具体活动包括开展学术研讨会、演讲会及研究会等，其中的一部分内容刊载于期刊《冲绳法政研究》及《所报》中。另外，本所还免费提供法律咨询，并接受学生们关于法律纠纷的咨询。

冲绳经济环境研究所

　　冲绳经济环境研究所成立于2009年4月。从国际性、跨学科的立场出发，将研究范畴限定在冲绳这一岛屿地区，开展经济及环境相关的联合研究，力求在学术研究发展的同时，与地区居民共享其研究成果。回归后至今40年，历经一代的时间，冲绳积累了各种技术经验。特别值得一提的是，回归后观光及观光产业等战略产业一直肩负着重大的作用。但是，冲绳与本土的经济差距及高失业率的问题仍未消除，而且大规模的地区开发引起的环境破坏及地球环境问题、作为岛屿的不利性以及美军基地的存在所带来的不利等问题重重。换言之，目前需要兼顾自然环境保护与经济发展，即建立可持续发展社会。本研究所为了形成产业、政府及学术界之间的网络，并为地区社会做出广泛的贡献，举办学术研讨会、演讲会及研究会等。